ANNUAL REPORT
2009
Leading Institute: Universidade Federal de Pernambuco
Associated Institutions
Instituto de Botânica do São Paulo (IBt)
Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)
Jardim Botânico do Rio of Janeiro (JBRJ)
Museu Nacional (MN/UFRJ)
Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS)
Universidade Federal de Paraíba (UFPB)
Centro of Referência em Informação Ambiental (CRIA)
Rede Nacional de Ensino e Pesquisa (RNP)
Table of Contents
1
1.Introduction 4
2.Participants 5
3.Research Program in Taxonomy 8
4.Training 10
Best practices 10
New taxonomists 11
5.Virtual Herbarium 13
Baseline 13
Work carried out 15
Change of protocol (from DiGIR to Tapir) 15
Inclusion of new collections to the speciesLink network 20
Website 21
New outputs of the information system 21
Data repatriation 22
Defining a strategy for data repatriation 25
Maintenance 26
6.Bibliographic Production 27
7.Progress Indicators 27
8.Final Considerations 31
9.Annex. Bibliographic Production 32
1.Introduction
The Virtual Herbarium of Flora and Fungi of Brazil is part of CNPq’s National Institutes of Science and Technology (INCT) Program. The Herbarium’s mission is to provide a free and open data infrastructure for the scientific community, for policy and decision makers, and for society in general. It intends to achieve these goals by integrating data from Brazilian herbaria and by repatriating data about plants collected in Brazil and deposited in herbaria outside the country.
To fulfill its mission the Virtual Herbarium aims to:
-
Expand the knowledge base about the diversity of flora and macroscopic fungi in Brazil;
-
Improve the quality of the holdings in Brazilian herbaria;
-
Encourage the formulation of public policies aimed at ensuring the sustainability of herbaria, the training of taxonomists, and the provision of support for biodiversity studies;
-
Make species occurrence data a fundamental instrument for decision making and for the formulation of public policies concerning biodiversity;
-
Encourage as a standard conduct, free and open data and information sharing in a comprehensive, useful and usable format; and,
-
Offer data and information to make environmental sustainability just as important as social and economic development in the formulation and assessment of public policies.
The Virtual Herbarium’s activities are focused on research, training, and knowledge transfer to society.
As to research, the Virtual Herbarium is involved in the study of the diversity and taxonomy of plants and macroscopic fungi and with the use of species-occurrence data in the formulation of public policies.
In the case of training, the Virtual Herbarium offers courses in taxonomy, curation of collections, and biodiversity informatics, aiming at providing researchers and technicians with better qualifications leading to an improvement in the quality of the Virtual Herbarium’s holdings. It also supports the training of Masters and PhD students taking graduate courses in botany.
Concerning the transfer of knowledge to society, the Virtual Herbarium is developing an open access, online data system about Brazilian plants and fungi. The integration and public availability of these data will support the analysis of specialists from different sectors, leading to a quicker advancement of knowledge.
2.Participants
Team Leader: Leonor Costa Maia
Assistent Team Leader: Maria Regina de V. Barbosa
Steering Committee:
Leonor Costa Maia (UFPE)
Maria Regina de V. Barbosa (UFPB)
Ariane Luna Peixoto (JBRJ)
Mariângela Menezes (MN-UFRJ)
João Renato Stehmann (UFMG)
Ana Odete Santos Vieira (UEL)
Coordinators of specific areas:
José Rubens Pirani – USP (taxonomy of phanerogams)
Kátia Cavalcanti Pôrto – UFPE (taxonomy of criptogams)
Ariane Luna Peixoto – JBRJ (training)
Ana Odete Santos Vieira – UEL (articulation)
Maria Regina Barbosa – UFPB (products)
Dora Ann Lange Canhos – CRIA (online information systems and products)
Leading Institute: Universidade Federal de Pernambuco
Associate Institutions
Museu Nacional (MN/UFRJ)
Instituto de Botânica (IBt)
Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)
Jardim Botânico do Rio de Janeiro (JBRJ)
Universidade Federal da Paraíba (UFPB)
Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS)
Centro de Referência em Informação Ambiental (CRIA)
Rede Nacional de Ensino e Pesquisa (RNP)
Associate Herbaria and Collaborators/Curators
Herbário da Embrapa Semiárido (HTSA)– Lúcia Helena Kiill
Herbário da Faculdade São Lucas, Roraima (HFSL) – Ana Cristina Ramos de Souza
Herbário da Fundação do Meio Amb., Ciência e Tecnol. de Roraima (MIRR) – Andréia S. Flores
Herbário da Universidade de São Paulo (SPF) – Renato de Mello-Silva
Herbário da Universidade Estadual de Londrina (UEL) – Ana Odete Santos Vieira
Herbário da Universidade Estadual de Feira de Santana (HUEFS) – Luciano P. de Queiroz
Herbário da Universidade Federal da Paraíba (EAN) – Leonardo Pessoa Félix
Herbário da Universidade Federal da Paraíba (JPB) – Maria Regina de V. Barbosa
Herbário da Universidade Federal de Minas Gerais (BHCB) – Alexandre Salino
Herbário da Universidade Federal de Pernambuco (UFP) – Marlene C. de Alencar Barbosa
Herbário da Universidade Federal de Pernambuco (URM) – Leonor Costa Maia
Herbário da Universidade Federal de Sergipe (ASE) – Ana Paula Prata
Herbário da Universidade Federal de Goiás (UFG) – José Angelo Rizzo
Herbário da Universidade Federal de Brasília (UB) – Carolyn Proença
Herbário da Universidade Federal do Ceará (EAC) – Maria Iracema B. Loiola
Herbário da Universidade Federal do Piauí (TEPB) - Roseli Farias M. de Barros.
Herbário da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN) – Jomar G. Jardim
Herbário da Universidade Federal do Vale do São Francisco (HVASF) - José A. Siqueira Filho
Herbário da Universidade Federal Rural do Semiárido (MOSS) - Leandro de O. F. de Sousa
Herbário da Universidade Federal Rural de Pernambuco (HST) – Ângela M. de M. Freitas
Herbário da Universidade Federal Rural de Pernambuco (PEUFR)– M.Elisabeth B. Pedrosa
Herbário do Centro de Pesquisas da Lavoura Cacaueira (CEPEC) – André Márcio Amorim
Herbário do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA) - Rita de Cássia Araújo Pereira
Herbário do Instituto de Meio Ambiente de Alagoas (IMA) – Rosângela P. de Lyra Lemos
Herbário do Instituto de Botânica de São Paulo (SP) – Maria Candida Henrique Mamede
Herbário do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) – Carlos H. Franciscon
Herbário do Jardim Botânico do Rio de Janeiro (RB) – Rafaela C. Forzza
Herbário do Museu Nacional (R) – Luci de Senna Valle
Researchers
-
Name
|
Institution, State
|
CNPq Fellow
|
Adriana de Mello Gugliotta
|
IBt, SP
|
-
|
Alexandre Salino
|
UFMG, MG
|
PQ 2
|
Amélia Iaeca Kanagawa
|
UFPB, PB
|
-
|
Ana Cristina Ramos de Souza
|
FSL, RO
|
-
|
Ana Luiza Du Bocage Neta
|
IPA, PE
|
-
|
Ana Maria Benko Iseppon
|
UFPE, PE
|
PQ 1D
|
Ana Odete Santos Vieira
|
UEL, PR
|
-
|
Andreia Silva Flores
|
MIRR, RO
|
-
|
Ana Paula Prata
|
UFS, SE
|
-
|
Andre Marcio Araujo Amorim
|
UESC, BA
|
PQ 2
|
Andréa Ferreira da Costa
|
UFRJ, RJ
|
-
|
Ângela Maria de Miranda Freitas
|
UFRPE, PE
|
-
|
Ariane Luna Peixoto
|
JBRJ, RJ
|
PQ 1B
|
Ariadna Valentina de F. e Lopes
|
UFPE, PE
|
PQ 2
|
Carolyn Elinore Barnes Proença
|
UnB, DF
|
-
|
Cássio Van Den Berg
|
UEFS, BA
|
PQ 1D
|
Célia Leite Sant’Anna
|
IBt, SP
|
-
|
Célio Ubirajara Magalhães Filho
|
INPA, AM
|
PQ 2
|
Dora Ann Lange Canhos
|
CRIA, SP
|
-
|
Francisca Araújo
|
UFC, CE
|
-
|
Gladstone Alves da Silva
|
UFPE, PE
|
-
|
Isabel Cristina Sobreira Machado
|
UFPE, PE
|
PQ 1B
|
Iuri G. Baseia
|
UFRN, RN
|
PQ 1D
|
Jefferson Prado
|
IBt, SP
|
PQ 1B
|
João Renato Stehmann
|
UFMG, MG
|
PQ 1D
|
José Alves de Siqueira Filho
|
UNIVASF, PE
|
-
|
José Laurindo C. dos Santos
|
INPA, AM
|
-
|
José Luis Bezerra
|
CEPLAC, BA
|
PQ 1D
|
José Rubens Pirani
|
USP, SP
|
PQ 1A
|
Kátia Cavalcanti Porto
|
UFPE, PE
|
PQ 1D
|
Laíse de Holanda C. Andrade
|
UFPE, PE
|
PQ 1A
|
Leandro de O.F. de Souza
|
UFERSA, RN
|
-
|
Leonardo Pessoa Félix
|
UFPB, PB
|
|
Leonor Costa Maia
|
UFPE, PE
|
PQ 1B
|
Lígia Queiroz Matias
|
UFC, CE
|
-
|
Luci de Senna-Valle
|
MN-UFRJ
|
-
|
Lucia Garcez Lohmann
|
USP, SP
|
-
|
Luciano Paganucci de Queiroz
|
UEFS, BA
|
PQ 1D
|
Luis Fernando P. Gusmão
|
UEFS, BA
|
-
|
Marcela Eugênia da S. Cáceres
|
UFS, SE
|
PQ 2
|
Marcelo Tabarelli
|
UFPE, PE
|
PQ 1A
|
Marcos Sobral
|
UFSJ, MG
|
-
|
Marcus Alberto Nadruz Coelho
|
JBRJ, RJ
|
-
|
Marccus Vinícius Alves
|
UFPE, PE
|
-
|
Maria Auxiliadora Cavalcanti
|
UFPE, PE
|
PQ 2
|
Maria Alice Neves
|
UFPB, PB
|
-
|
Maria Candida Henrique Mamede
|
IBt, SP
|
PQ 2
|
Maria das Graças M. de Souza
|
UnB, DF
|
-
|
Maria de Fátima Figueiredo Melo
|
INPA, AM
|
-
|
Maria Elizabeth B. Pedrosa
|
UFRPE, PE
|
-
|
Maria Iracema Bezerra Loiola
|
UFC, CE
|
-
|
Maria Regina de V. Barbosa
|
UFPB, PB
|
PQ 2
|
Mariângela Menezes
|
UFRJ, RJ
|
PQ 2
|
Marlene de Alencar Barbosa
|
UFPE, PE
|
-
|
Marli Pires Morim
|
JBRJ, RJ
|
-
|
Rafaela Campostrini Forzza
|
JBRJ, RJ
|
PQ 2
|
Regina Célia de Oliveira
|
UnB, DF
|
-
|
Rita Baltazar de Lima
|
UFPB, PB
|
-
|
Rita de Cássia Araújo Pereira
|
IPA, PE
|
-
|
Rosângela P. de Lyra Lemos
|
IMA, AL
|
-
|
Roseli Farias M. de Barros
|
UFPI, PI
|
-
|
Ruy José Válka Alves
|
JBRJ, RJ
|
PQ 2
|
Sérgio Romaniuc-Neto
|
USP, SP
|
|
Tatiana Gibertoni
|
UFPE, PE
|
PQ 2
|
Vanderlei Perez Canhos
|
CRIA, SP
|
-
|
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